FEF-Schiffe im aktiven Dienst
| Name | Register | Missionsziele |
| Starbase Daedalon | FEF-002 | Technische Forschungsstation |
| USS Doohan | FEF-41397-C | Multimissionsschiff (Flaggschiff) |
| USS Yurumi | FEF-73006 | Forschung |
| USS Draco | FEF-10903 | Langstreckenforschung / Diplomatie |
| USS Tyrion | FEF-43001 | Kampf |
| USS Trinity | FEF-76661 | Deep Space Missions |
| USS Bigfoot | FEF-12298 | Transport |
| USS N'grak | FEF-14092 | großer Aufklärer (ehemals USS Rurouni) |
| USS Canary | FEF-29103 | Partyschiff der Flotte (ehemals USS Sparrow) |
| USS Emanon | FEF-70203 | Sonnen- und Gasnebelforschung |
| Shuttle Eagle Eye | FEF-20403 | Kurzstrecke |
| USS Entropy | FEF-80296 | Forschung / Erkundung |
| USS Black Pearl | FEF-91402 | großer Aufklärer |
| USS Blankwahn | FEF-40610 | Lazaret-/Kampfschiff |
Nicht besetzte FEF-Schiffe
| Name | Register | Missionsziele |
| USS Aspidonia | FEF-21209 | Kurzstreckenforschung |
| USS Otarion | FEF-17059 | Forschung |
| USS Barracuda | FEF-42801 | Kampf |
| USS Doberman | FEF-60398 | Kampf |
| USS Poseidon | FEF-98603 | Deep Space Missions |
| USS Protheus | FEF-20699 | Multimissionsschiff |
| USS Sparrow | FEF-12310-A | Aufklärer / Pilotenausbildung |
| USS Scarab | FEF-98077 | Flottenkampf |
FEF-Schiffe im S-Verband (serienreife Schiffe)
| Name | Register | Missionsziele |
| USS Delvy | FEF-41397-B | Forschung (Leitschiff S-Verband) |
Weitere in Bau befindliche FEF-Schiffe
USS Tripoli (FEF-30103)
USS Fishbone (FEF-23112)
USS Orion (FEF-16703)
USS Pioneer (FEF-20914)
Ehemalige FEF-Schiffe
| Name | Register | Missionsziele |
| Starbase 51 | FEF-001 | Technische Forschungsstation |
| USS Odysseus | FEF-98036 | Forschung |
| USS Duopus | FEF-50798 | Forschung |
| USS Mapleleaf | FEF-70298 | Langstreckenforschung / Diplomatie / Erstkontakte |
| USS Arrowhead | FEF-91197 | Langstreckenforschung / Diplomatie / Erstkontakte |
| USS Wotan | FEF-39806 | Wissenschaft |
| USS Xentra | FEF-98306 | Forschung |
| USS Loop | FEF-10298 | Langstreckenforschung / Diplomatie |
| USS Protector | FEF-22101 | kleines Multimissionsschiff |
| USS Flatlander | FEF-19201 | Multimissionsschiff |
| USS Explorer | FEF-41397 | Forschung (Flaggschiff) |
| USS Journer | FEF-41397-A | Forschung (Flaggschiff) |
| USS Epsilus | NCC-14100 | Multimissionsschiff |
| USS Triangle | FEF-21098 | Kolonialisierung / atmosphärische Forschung |
| USS Volition | FEF-71198 | Multimissionsschiff |
| USS Volcano | FEF-11699 | Forschung |
| USS Destiny | FEF-76106 | Pilotenausbildung / Scout |
| USS Pangea | FEF-51001 | Forschung |
| USS Anakonda | FEF-51698 | Multimissionsschiff |
| USS Biohazard | FEF-10093 | Waffentestschiff |
| USS Vampire | FEF-31607 | Kampf |
| USS Supernova | FEF-28202 | Sonnen- und Gasnebelforschung |
